キシリトールにはむし歯予防に役立つ2つの効果があります。1つめは歯の再石灰化をねらう効果です。キシリトールは唾液中に含まれるカルシウムを安定化させて、無機成分を失った歯の表面（エナメル質）に取り込みやすくします。
2つめはプラーク中のむし歯菌（ミュータンス菌）を減少させ、酸の生成を抑える作用です。ミュータンス菌は、食品中の糖をエネルギー源として取り込み酸を生成します。この酸がむし歯の原因になるのです。しかしミュータンス菌はキシリトールを取り込むことができないため弱ってしまい、酸も生成できなくなります。